Project

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Ancient seafaring: a palaeogenomic exploration

Applicant Malaspinas Anna Sapfo
Number 181251
Funding scheme Eccellenza grant
Research institution Département de biologie computationnelle Faculté de biologie et de médecine Université de Lausanne
Institution of higher education University of Lausanne - LA
Main discipline Genetics
Start/End 01.11.2020 - 31.10.2025
Approved amount 1'500'000.00
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All Disciplines (2)

Discipline
Genetics
Mathematics

Keywords (3)

population genomics; ancient DNA; theoretical population genetics

Lay Summary (French)

Lead
Une exploration paléogénomique des peuples navigateurs
Lay summary

Le domaine de l’ADN ancien est récemment entré dans l’ère génomique. Il est à présent techniquement possible de générer des données à grande échelle pour des centaines d’individus de toutes les régions du monde. C’est ainsi que ces dernières années, l’analyse de ces données nous a permis de tester des hypothèses archéologiques et paléoanthropologiques et de générer des résultats qui ont permis de réécrire des chapitres de l’histoire de l’humanité. 

Les objectifs de ce projet sont d’une part de générer et d’analyser des données génomiques de populations humaines pour comprendre le peuplement de groupes d’îles du Pacifique et de la mer Egée et d’autre part de développer des méthodes statistiques adaptées à des données à large échelle pour pouvoir inférer l’histoire démographique de ces régions du monde. 

L’originalité de ce projet tient en partie dans sa nature multidisciplinaire, tant au niveau de la méthodologie que de sa pertinence. Les résultats obtenus nous permettront de contraster des populations insulaires et ainsi de mieux comprendre les différences et similitudes biologiques et culturelles de marins vivant de part le monde. Nos résultats pourront également être utiles aux recherches dans le domaine de l’anthropologie puisqu’il s’agit de reconstruire la préhistoire de ces populations. Finalement, l’étude des traces ADN de microbes dans ces ossements humains permettront de mieux comprendre la prévalence de certaines maladies au cours du temps. 


Direct link to Lay Summary Last update: 26.10.2020

Responsible applicant and co-applicants

Abstract

BACKGROUND Ancient DNA research has recently entered the genomics era. Performing“ancient population genomics” is now technically possible. In recent years, utilizing this temporal data has allowed us to test archeological and paleoanthropological theories and to generate new results that in some cases have rewritten entire chapters of the history of the human species.OBJECTIVES The goals of the proposed research are to; (i) generate and analyse data from areas that have, as yet, not been genomically analysed in detail, to understand how humans originally peopled island groups across the world, and how they responded to novel environments, such as new diets and pathogens; (ii) develop scalable statistical approaches to infer the most likely scenarios for the peopling of those regions. Specifically, we aim at developing methods to infer demographic parameters from the simultaneous analysis of the colossal ancient and modern genetic, isotopic and morphological datasets that have become available and that we will generate. EXPECTED RESULTS AND IMPACT The strength and originality of this proposal lies in its multidisciplinary nature, both in terms of methodology and relevance. Ecological: Our comparative results into the timing and the connectivity of the islands will showcase cultural and biological differences among two skilled seafaring human groups. Anthropological: Our results will allow to test aspects of the story of human dispersal and interaction across the seas. Medical: We will gain insights into the causal agents of infectious diseases, as well as the age and prevalence of infectious and genetic diseases through time. Methodological: The scalable methods developed in this project will allow us to infer demographic parameters for dozens of populations at once and thus benefit the growing field of ancient and modern genomics.
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