Lead
How the genome folds, packs and distributes in the cell's nucleus matters for gene expression, repair and replication. The genome's organizing principles largely remain a mystery and only starts being investigated, mostly in animal models. Yet, plant genomes have much to reveal, especially in relation to the extraordinary plasticity of plant cells.

Lay summary
Chez les Eukaryotes (plantes, animaux, champignons..), le genome est encapsulé dans le noyau, un compartiment cellulaire qui offre une plateforme de regulation de l'expression des gènes mais aussi de la reparation et réplication du génome. Au cours des dernières années, les chercheurs ont montré un nouveau niveau de régulation qui s'opère en trois dimensions dans le noyau. La distribution spatiale, la segmentation  en domaines et les degrés de compaction du génome ne sont pas aléatoires et varient en fonction du type cellulaire ou de son état physiologique. Un nouvel élan a été donné qui a créé le champ de recherche '3D Genomics' . Celui ci s'appuie sur les synergies de plusieurs disciplines, la biologie moléculaire, l'imagerie de pointe à haute résolution, le traitement d'image et la modélisation mathématique. Quels sont les principes d'organisation spatiale instruisant les fonctions du génome? Comment ces principes se retrouvent-ils ou diffèrent entre animaux, plantes ou champignons? Quel est leur impact pour le fonctionnement de la cellule, de l'organisme? Notre projet contribue à réponde à cette question, par la description de domaines choisis dans le génome de la plante modèle Arabidopsis, concernant leur distribution spatiale et degré de compaction, leur composition épigénétique, et leur dynamique (ou stabilité) dans un contexte de reprogrammation cellulaire.