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HIV-1 Transmission in Switzerland: viral transmission traits, superinfection and drug resistance

English title HIV-1 Transmission in Switzerland: viral transmission traits, superinfection and drug resistance
Applicant Günthard Huldrych Fritz
Number 179571
Funding scheme Project funding (special)
Research institution Klinik für Infektionskrankheiten und Spitalhygiene Universitätsspital Zürich
Institution of higher education University of Zurich - ZH
Main discipline Medical Microbiology
Start/End 01.05.2018 - 30.04.2022
Approved amount 834'889.00
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All Disciplines (2)

Discipline
Medical Microbiology
Experimental Microbiology

Keywords (15)

Recombination; antiretroviral treatment; superinfection; transmission; Zurich Primary HIV Infection Study; Swiss HIV Cohort Study; replication capacity; HIV-1; neutralizing antibodies; phylogenetics; next generation sequencing; Primary HIV infection; drug resistance; Large nested project; SHCS

Lay Summary (German)

Lead
Dieses Projekt will helfen, die Biologie von übertragenen HIV-1 Viren besser zu verstehen. Deshalb werden Viren von Individuen studiert, die diese an einen anderen Menschen weitergeben und zusätzlich wollen wir systematisch untersuchen, weshalb und wie häufig Superinfektion auftreten kann. Schliesslich werden wir die Uebertragung von resistenten HI-Viren studieren und v. a. auf nicht-B Subtypen fokussieren. Die Studie basiert auf zwei qualitativ hochstehenden longitudinalen Patientenstudien: der Schweizerischen HIV Kohortenstudie und der Zurich Primary HIV Infection Study.
Lay summary

Mit diesem Projekt wollen wir bestimmte Charakteristika der HIV-1 Infektion besser verstehen. Im 1. Teil wollen wir herausfinden, ob übertragene Viren spezielle genetische oder phänotypische Merkmale aufweisen. Oder in anderen Worten: Wir möchten studieren, ob Virus-Varianten, die übertragen werden bestimmte genetische oder biologische "Verhaltensmerkmale" aufweisen. Im 2. Teil wollen wir systematisch untersuchen, wie häufig HIV Superinfektionen (SI) auftreten  und welches die Risikofaktoren dafür sind. Bisher gibt es kaum systematische Studien zur Häufigkeit von Superinfektionen und deren Risikofaktoren in repräsentativen Populationen von HIV-1 infizierten Menschen. Bisher haben wir über 300 potentielle SI Fälle identifizert. Diese werden wir mittels einer detaillierten virusgenetischen Analyse bestätigen und Rekombination und Risikofaktoren bestimmen. Wir werden auch Wirtsgenome analysieren, um zu schauen, ob allenfalls menschliche genetische Faktoren dafür mitverantwortlich sind. Zusätzlich werden wir die virale Fitness und neutralisierende Antikörper bestimmen in den Patienten und die "viral setpoints" (virus equilibrium in Patienten vor Therapie) bestimmen in den SI Fällen und ausgewählten kontrollen, um zu testen, ob SI Individuen eine raschere Krankheitsprogression aufweisen. Im 3. Teil werden wir die Uebertragung von resistenten HIV-1 Viren untersuchen. Wir werden uns speziell auf Nicht-B Subtypen und auf neuere Medikamentenklassen konzentrieren. Insbesondere interessiert uns auch das Vorliegen und die Evolution von viralen Varianten, die Resistenzmutationen tragen und in geringer Frequenz vorliegen.  

Direct link to Lay Summary Last update: 06.04.2018

Responsible applicant and co-applicants

Employees

Project partner

Associated projects

Number Title Start Funding scheme
159868 HIV-1 Transmission in Switzerland: viral transmission traits, superinfection and drug resistance 01.05.2015 Project funding (special)

Abstract

This translational research project is a continuation of SNF 159868. We aim to unravel traits of HIV transmission in three conceptually different situations of high clinical relevance: transmission leading to de novo infection (Aim 1), spread of HIV between infected individuals (conferred to as superinfection (SI); Aim 2) and transmission of drug resistant virus (Aim 3). The proposed studies are based on two renowned longitudinal studies with extensive biobanks: The Swiss HIV Cohort and the Zurich Primary HIV-1 infection study (ZPHI).
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