Project

Discipline

molecular evolution; Americas; population genomics; ancient DNA; Polynesia

Lead
L´hypothèse d´un contact entre les populations humaines d´Amériques et de Polynésie date du début du XXème siècle. Bien que cette question soit encore largement débattue, elle n’a été que peu abordée avec des données génomiques. L’utilisation de ce genre de données dans le cadre de ce projet devrait permettre d’élucider divers aspects telle que la temporalité ou le nombre d’individus impliqués dans un contact potentiel entre ces populations éloignées.
Lay summary
Titre Caractérisation des migrations humaines avec des données anciennes et modernes ou les limites de l’expansion Polynésienne dans l’océan pacifique Contenu et objectifs du travail de recherche  La colonisation des Amériques fait l’objet de nombreuses études depuis plus d’un siècle. Il est aujourd’hui accepté que les humains aient colonisé les Amériques il y a 15 à 30 mille ans. Des contacts secondaires pré historiques ou historiques ont également été proposés, notamment avec la Polynésie. Mais beaucoup reste encore à découvrir quand à ce contact secondaire potentiel. Ce projet porte sur l’étude de ce contact secondaire encore mal élucidé à travers la génération et l’analyse de données génomiques humaines pour des populations humaines encore peu ou pas caractérisées génétiquement. Dans un premier temps, nous irons collecter des échantillons modernes et anciens en Polynésie française et dans divers musées au Brésil et sur l’ile de paques. Nous développerons en parallèle des modèles de génétique des populations applicables aux données collectées. Puis nous génèrerons les données génomiques que nous analyserons dans la phase finale du projet.   Nos recherches aideront à mieux comprendre les mouvements des Polynésiens dans le temps et l’espace au cours de leurs voyages à travers l’océan pacifique.   Contexte scientifique et social du projet de recherche L’émergence de données génomiques permet ces dernières années de réévaluer les théories concernant le mode et tempo de colonisation du monde par les humains depuis leur apparition jusqu’à nos jours. Pour mieux comprendre nos origines il est donc important à la fois de collecter des données génomiques mais aussi de développer de modèles permettant d’inférer des paramètres démographiques qui relatent les populations entre elles dans le temps et l’espace. Mots-clés Génétique des populations, AND ancien, Polynésie, Ameriques, évolution moléculaire

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Last update: 29.04.2015

Communication	Title	Media	Place	Year

Number	Title	Start	Funding scheme

BACKGROUND: The mode and tempo of the colonization of the Americas before it was discovered by Europeans remains unresolved. After more than a century of study the majority of available genetic, archaeological and linguistic evidence supports one or more pre-Columbian migration event(s) from Siberia to North America around 15-30 thousand years before present, followed by an expansion into South America. Prehistoric or historic connections between South America and Southeast Asia/Oceania have been noted including similarities in culture, human skull morphology and domestic breeds, but so far no genetic evidence from humans has been found to support such contact. We recently found that skeletal remains from Brazil belonging to two indigenous Botocudos presented a combination of mitochondrial DNA variants common in present day Oceanian populations. AIMS: I propose to investigate the question of a Polynesian-South American contact with genomic data. Specifically, we aim to (I) infer the colonization of Polynesia using genetic data from present-day Polynesians, (II) infer the structure of the indigenous Botocudo of Brazil, (III) characterize the Polynesian-South American contact considering ancient and modern data jointly. The main questions I seek to answer are: (I) What was the mode and tempo of the colonization of Polynesia? Does the genetic data fit the archeological data? Which Polynesian populations exhibit a Native American signal? (II) What is the structure within the Botocudo population? How do they relate to other Native American populations? Is there more than two individuals with a Polynesian signal? How strong is the Polynesian signal? (III) When did the Polynesian and South American populations first began admixing? Was it before or after European contact with South America/Polynesia? What was the direction of the gene flow? RELEVANCE: The results will contribute to deepen our understanding of the peopling of the world, ultimately having relevance to enduring questions such as: Where do we all come from? Who are our ancestors? The statistical methods will be applicable to any migration/admixture event across the tree of life. They will also benefit the growing field of ancient genomics and other fields where data are collected at several time points, such as experimental evolution and epidemiology. The generated data will be of general interest to investigate other population genetics aspect, including related human migration events and the impact of a range expansion in terms of genetic load. Finally, by the end of the project, we should have all the pieces necessary to solve the decades-old puzzle concerning the colonization of the Americas.