Project

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DIVERSITY, EVOLUTION AND CONTROL OF DENGUE VIRUS

English title DIVERSITY, EVOLUTION AND CONTROL OF DENGUE VIRUS
Applicant Di Giallonardo Francesca
Number 151594
Funding scheme Early Postdoc.Mobility
Research institution School of Biological Sciences The University of Sydney
Institution of higher education Institution abroad - IACH
Main discipline Molecular Biology
Start/End 01.04.2014 - 30.09.2015
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All Disciplines (2)

Discipline
Molecular Biology
Genetics

Keywords (4)

Travellers; Vector control; Dengue; Viral diversity

Lay Summary (German)

Lead
Das Dengue Virus ist weltweit in den subtropischen und tropischen Regionen verbreiten und jährlich infizieren sich über 390 Millionen Menschen. Eine Infektion mit dem Dengue Virus ist meistens asymptomatisch, kann aber bei etwa ein Drittel der Infizierten das hämorrhagische Denguefieber oder das Dengue-Schock-Syndrom auslösen, beides sind lebensbedrohliche Erkrankungen. Zurzeit sind keine Medikamente und auch keine Impfung gegen das Virus vorhanden.
Lay summary

Inhalt und Ziel des Forschungsprojekts

 

In diesem Forschungsprojekt soll die Vielfalt und Evolution des Dengue Virus in Australien und Südostasien ermittelt werden. Mithilfe von Sequenzanalysen und Stammbäumen soll bestimmt werden, wo welche Serotypen vorkommen und wie sich deren Verbreitung über die Jahre verändert hat. Ein Teil des Projekts konzentriert sich auf erkrankte Reisende, die aus Südostasien nach Australien zurückkehren. Diese Personen können das Dengue Virus auf Einheimische übertragen und so eine Epidemie auslösen. Die Sequenzanalyse solcher Patienten kann bestimmen wo die Epidemie ihren Ursprung hatte und wie sie sich verbreitet hat.

Ein weiterer Teil des Projekts untersucht den Einfluss der Tigermücken-Eindämmung mittels eines Biopathogen. Die Tigermücke wurde mit einem Bakterium infiziert, das die Lebenserwartung der Mücke senkt und so die Verbreitung des Virus verhindern soll. Mittels Sequenzvergleich soll ermittelt werde, ob die Vielfalt von Dengue durch das Pathogen reduziert wurde und ob das Vorkommen der Viren zurückgegangen ist.

 

 

Wissenschaftlicher und gesellschaftlicher Kontext des Forschungsprojekts

 

Dieses Projekt wird Veränderungen in der Vielfalt und Verbreitung von Dengue Viren in Australien und Südostasien erforschen. Ausserdem untersucht diese Arbeit on die Einführung eines Mückenpathogen einen Einfluss auf die Verbreitung von Dengue Infektionen haben wird.

 

Keywords

 

Dengue, Wolbachia, travellers, diversity, transmission

Direct link to Lay Summary Last update: 06.01.2014

Responsible applicant and co-applicants

Publications

Publication
Fluid Spatial Dynamics of West Nile Virus in the United States: Rapid Spread in a Permissive Host Environment
Di Giallonardo Francesca, Geoghegan Jemma L., Docherty Douglas E., McLean Robert G., Zody Michael C., Qu James, Yang Xiao, Birren Bruce W., Malboeuf Christine M., Newman Ruchi M., Ip Hon S., Holmes Edward C. (2016), Fluid Spatial Dynamics of West Nile Virus in the United States: Rapid Spread in a Permissive Host Environment, in JOURNAL OF VIROLOGY, 90(2), 862-872.
Virological factors that increase the transmissibility of emerging human viruses
Geoghegan Jemma L., Senior Alistair M., Di Giallonardo Francesca, Holmes Edward C. (2016), Virological factors that increase the transmissibility of emerging human viruses, in PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 113(15), 4170-4175.
Exploring Host–Pathogen Interactions through Biological Control
Di Giallonardo Francesca, Holmes Edward C. (2015), Exploring Host–Pathogen Interactions through Biological Control, in PLoS Pathogens, 11(6), e1004865.
Viral biocontrol: grand experiments in disease emergence and evolution
Di Giallonardo Francesca, Holmes Edward C. (2015), Viral biocontrol: grand experiments in disease emergence and evolution, in TRENDS IN MICROBIOLOGY, 23(2), 83-90.
Substitution model adequacy and assessing the reliability of estimates of virus evolutionary rates and time scales
Duchêne Sebastián, Di Giallonardo Francesca, Holmes Edward C, Substitution model adequacy and assessing the reliability of estimates of virus evolutionary rates and time scales, in Molecular Biology And Evolution, msv207.

Scientific events

Active participation

Title Type of contribution Title of article or contribution Date Place Persons involved
CPC EMCR SYMPOSIUM Poster Fluid spatial dynamics of West Nile virus in the USA: rapid spread in a permissive host environment 20.08.2015 Sydney, Australia Di Giallonardo Francesca;


Associated projects

Number Title Start Funding scheme
174462 Revealing the Phylodynamics of HIV-1 in Australia 01.01.2018 Advanced Postdoc.Mobility

Abstract

Dengue is an emerging viral disease that is transmitted by the mosquito Aedes aegypti and is the cause of dengue fever and a variety of more severe syndromes including dengue haemorrhagic fever. Around 100 million people experience overt dengue infections each year, and to date no effective antivirals or vaccines are available. Although infection provides a lifelong immunity to a specific serotype, subsequent infection by another serotype increases the risk of progression to severe disease. Dengue virus has recently expanded its geographical range and epidemics are now a regular occurrence in places such as northern Queensland, Australia. The virus is introduced by travellers from Asia, and is spread by local Aedes aegytpi populations, posing a major public health threat. An innovative and promising technique to reduce the burden of dengue is Wolbachia pipientis, a bacterium that significantly inhibits dengue replication. There is an urgent need to better characterise the circulating genetic diversity of dengue populations and therein improve vaccine specificity, document the diversity of strains entering Australia, and the impact of Wolbachia in blocking virus transmission. To address these questions I will undertake a systematic research program to collect and analyse a diverse set of dengue viral sequences incorporating (i) global viral strains, (ii) Australian travellers infected abroad and returning to Australia, and (iii) viral strains sampled from the sites of Wolbachia intervention. On each data set I will perform state-of-the-art analyses of the extent, patterns and determinants of viral genetic diversity, reveal the pathways of viral spread on global and regional (Asia-Pacific) scales, examine how these strains differ from those in vaccine preparations (and therein improve design), and determine the impact of Wolbachia pipientis on dengue transmission in study populations in Australia and Vietnam.
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