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Biologische Prozesse beobachtet man auf der Ebene von Atomen, Molekülen, Molekülkomplexen, Organellen, Zellen, Geweben, einzelnen Organismen oder Oekosystemen. Zell- und Molekularbiologen verwenden dazu mikroskopische Techniken, beispielsweise Fluoreszenzmikroskopie. Bei herkömmlicher Fluoreszenzmikroskopie, zum Beispiel der konfokalen Fluoreszenzmikroskopie, wird ein Objekt durch ein Objektiv beleuchtet und mittels Fluoreszenzbestimmung Punkt für Punkt vermessen. Bei der Lichtscheiben-Fluoreszenzmikroskopie wird eine Mikrometer-dünne Schicht von der Seite des Objekts beleuchtet. Das abgestrahlte Fluoreszenzlicht wird von einem Objektiv senkrecht zur Beleuchtungsebene eingesammelt und von einer Kamera in digitale Signale umgewandelt, die dann gespeichert werden. Zur Erzeugung einer 3-dimensionalen Abbildung wird das Lichtblatt schrittweise durch das Objekt verschoben. Ausgeklügelte Bildanalyse konstruiert dann aus diesen Daten ein 3-dimensionales Objekt. Verglichen mit herkömmlicher Fluoreszenzmikroskopie hat die Lichtscheiben-Fluoreszenzmikroskopie eine deutliche bessere örtliche Auflösung, direkt abhängig von der Dicke der Lichtscheibe, sowie einen stark reduzierten Bildhintergrund. Zudem wird das Objekt, durch die Reduktion der Beleuchtung auf ein dünnes Lichtblatt weniger stark durch Bleichen oder Licht-induzierten Stress beeinträchtigt. Das Lichtscheiben-Fluoreszenzmikroskop Z1 von Zeiss wird vorallem in der Zell- und Entwicklungsbiologie, Infektionsforschung, Krebsforschung, Immunologie oder Neurobiologie verwendet. Mit diesem Mikroskop werden 3-dimensionale Zellverbände, Organellen oder ganze Organismen mit minimaler Beeinflussung in relativ natürlicher Umgebung sichtbar gemacht.  Das Mikroskop wird im Zentrum für Mikroskopie und Bildanalyse der Universität Zürich installiert und steht den Forschungsgruppen der Universität und interessierten Gruppen der ETH oder anderer schweizerischer Universitäten zur Verfügung.