Project

Back to overview

Chemical Space Design of Small Molecules and Peptides

English title Chemical Space Design of Small Molecules and Peptides
Applicant Reymond Jean-Louis
Number 178998
Funding scheme Project funding (Div. I-III)
Research institution Departement für Chemie und Biochemie Universität Bern
Institution of higher education University of Berne - BE
Main discipline Organic Chemistry
Start/End 01.04.2018 - 31.03.2022
Approved amount 1'489'994.00
Show all

Keywords (7)

small molecule drugs; cheminformatics; chemical space; drug design; dendrimers; antimicrobial agents; peptides

Lay Summary (French)

Lead
L'espace chimique des molécules organiques et des peptides
Lay summary
Le progrès de la médecine moderne dépent en grande partie de la découverte de nouveaux médicaments. Dans ce projet nous abordons la conception de nouvelle classes de molécules thérapeutiques qui puissent surmonter les difficultés rencontrées avec la plupart des médicaments, qui sont le manque de sélectivité et la formation de métabolites. Nous abordons ce problème par le biais du concept de l'espace chimique, qui permet de décrire les propriétés moléculaires sous forme de coordonnées spatiales. Nous dévelopons des méthodes de calcul pour énumérer et explorer des bases de données de molécules de type "big data", par lesquelles nous choississons des molécules que nous synthétisons et testons ensuite au laboratoire. Nous nous intéressons particulièrement aux petites molécules organiques ainsi qu'aux peptides dendritiques et polycycliques. 
Direct link to Lay Summary Last update: 26.04.2018

Responsible applicant and co-applicants

Employees

Associated projects

Number Title Start Funding scheme
125762 NCCR TransCure: From transport physiology to identification of therapeutic targets (phase I) 01.11.2010 National Centres of Competence in Research (NCCRs)
167048 Antimicrobial peptide dendrimers (AMPD) and bicyclic peptides (AMBP) as therapeutic agents against multidrug resistant bacteria 01.03.2017 NRP 72 Antimicrobial Resistance
165997 Exploiting and Extending GDB for Drug Discovery 01.05.2016 Project funding (Div. I-III)
159941 A Chemical Space Approach to Bioactive Peptides 01.04.2015 Project funding (Div. I-III)
155982 Controlling multi-antibiotic resistant bacteria with antimicrobial peptide dendrimers (AMPD) 01.10.2015 Bilateral programmes

Abstract

The continuous discovery of new drugs is essential to the success of modern medicine. Here we address the question of designing new structural families of small molecule drugs and peptides to help overcome limitations encountered with currently used compound types such as lack of selectivity and metabolic instability. We guide our molecular designs by exploiting the concept of chemical space, which relates molecular properties to spatial coordinates. We aim to develop computational tools for enumerating and exploring large compound databases, and to synthesize, test and investigate compounds selected using these tools with focus on new small molecule building blocks, peptide dendrimers and polycyclic peptides.
-