Project

Discipline

Microbial ecology; Cooperation; Spatial ecology; Microbial communities; Range expansion; Denitrification; Evolutionary ecology; Antibiotic resistance

Lead
Wir untersuchen die Auswirkungen von aufeinanderfolgenden Ausbreitung auf die Ökosystemstabilität und die Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen.
Lay summary
Inhalt und Ziele des Forschungsprojekts Alle Organismen müssen sich irgendwann während ihrer Existenz räumlich ausbreiten. Eine räumliche Ausbreitung tritt auf, wenn eine Population von Organismen in ein noch nicht besiedeltes Gebiet expandiert. Oftmals erfolgt die räumliche Ausbreitung als Abfolge von aufeinanderfolgenden Ausbreitungen, bei welchen eine Population zuerst expandiert und sich eine oder mehrere andere Populationen danach ausbreiten. In der Natur sind räumliche Ausbreitungen allgegenwärtig, über die evolutionären Konsequenzen aufeinanderfolgender Ausbreitung fehlt uns jedoch grundlegendes Wissen. Das Ziel dieses Projektes ist es, zwei mögliche Konsequenzen der aufeinanderfolgenden Ausbreitung zu testen. Eine Konsequenz könnte sein, dass die aufeinanderfolgende Ausbreitung den Austausch von Genen zwischen verschiedenen Organismen fördert. Ein Beispiel dafür ist der Austausch von Antibiotikaresistenzgenen zwischen mikrobiellen Populationen im menschlichen Verdauungstrakt. Eine andere Konsequenz könnte sein, dass vorübergehende Schwankungen von Zusammenarbeit und Konflikt zwischen verschiedenen Populationen zu einem Kollaps des Ökosystems führen. Um die Relevanz dieser beiden Konsequenzen testen zu können, wird dieses Projekt ein Modell eines mikrobiellen Ökosystems in Experimenten und mathematischem Modellieren verwenden. Wissenschaftlicher und gesellschaftlicher Kontext des Forschungsprojekts Die Ergebnisse dieses Projektes werden unser grundlegendes Verständnis der Konsequenzen der räumlichen Ausbreitung bezüglich ökologischen und evolutionären Prozessen in Populationen verbessern. Insbesondere sollten sie helfen, die Auswirkungen von aufeinanderfolgenden Ausbreitung auf die Ausbreitung von Antibiotikaresistenzen vorherzusagen, was wichtige Auswirkungen darauf haben könnte, wie Antibiotika im klinischen Umfeld angewendet werden.

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Last update: 14.11.2017

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A vast amount of the natural microbial world lives attached to surfaces, such as the microbial communities residing in the human gut, in soil ecosystems, or on particulate matter in the open ocean. An inherent behavior of surface-attached microbial communities is that they must, at some point in their existence, undergo range expansion. A range expansion occurs when microbial communities expand into previously unoccupied space. Range expansions likely occur as a series of successive expansions, where one microbial strain expands first (the primary expansion) and one or more other microbial strains expand afterwards (secondary expansions). While successive range expansions are pervasive in nature, the consequences of successive range expansions remain poorly understood. How might successive range expansions affect the evolutionary processes acting on microbial communities? How might they affect the ecological functioning and stability of microbial communities? In this proposal, I postulate two potentially general consequences of successive range expansions. The first is that successive range expansions should promote the transfer of genes between different microbial strains, such as the transfer of antibiotic resistance genes in the human gut. The main hypothesis is that successive range expansions increase the number of cell-cell contacts between different strains, thus increasing the probability of gene transfer between those strains. To address this hypothesis, I propose specific experiments to address the following questions:•Do successive range expansions promote the transfer of genes between different microbial strains?•After acquiring beneficial genes, can recipient cells proliferate and establish within a successive range expansion? •How does the magnitude of benefits bestowed by newly acquired genes affect the proliferation and establishment of recipient cells?The second consequence is that temporal fluctuations between cooperation and conflict between different microbial strains during range expansions may cause ecosystems to collapse. The main hypothesis is that cooperation and conflict promote the emergence of different spatial cell arrangements, and these spatial cell arrangements are in conflict with each other (i.e. the arrangements that emerge during cooperation are detrimental during competition and vice versa). Fluctuations between cooperation and conflict may therefore destabilize ecosystems and promote their eventual collapse. To address this hypothesis, I propose specific experiments to address the following questions: •Do temporal fluctuations between cooperation and conflict promote the eventual collapse of ecosystems during range expansions?•Do feedbacks emerge that mitigate the destabilizing effects of such temporal fluctuations, thus slowing or preventing ecosystem collapse?•If ecosystems escape collapse, what are the mechanisms that enable escape?Together, answering these questions will significantly advance our basic understanding about the evolutionary and ecological consequences of microbial range expansions. Given that every surface-attached microbial community must undergo range expansions, the insights gained will be of potential importance for nearly any surface-attached microbial community, including those important for the environment, biotechnology, and human health and disease.