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PathoLink: Connecting biobanks to determine mechanisms of metastasis formation and chemoresistance

English title PathoLink: Connecting biobanks to determine mechanisms of metastasis formation and chemoresistance
Applicant Moch Holger
Number 172718
Funding scheme Biolink funds
Research institution Institut für Klinische Pathologie Departement für Pathologie Universitätsspital Zürich
Institution of higher education University of Zurich - ZH
Main discipline Experimental Cancer Research
Start/End 01.09.2017 - 31.12.2020
Approved amount 1'166'000.00
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All Disciplines (2)

Discipline
Experimental Cancer Research
Information Technology

Keywords (1)

PathoLink

Lay Summary (German)

Lead
Die Entstehung von Tochter-Geschwülsten (Metastasen) bedroht das Leben von Tumorpatienten. Die Aufklärung der Metastasierungsmechanismen, aber auch der Entstehung der Chemoresistenz erfordert die Untersuchung einer grossen Zahl von Tumorgewebe. Solches Tumorgewebe wird in verschiedenen Tumorbanken in der Schweiz gelagert. Das Projekt leistet einen Beitrag, Tumorgewebebanken zu vernetzen, um für genomische und andere Untersuchungen Forschern ausreichend Gewebe zur Verfügung stellen zu können.
Lay summary

Inhalt und Ziele des Forschungsprojekts

Mit Hilfe genomischer Untersuchungen mittels neuer Technologien können zahlreiche Erkenntnisse zur Entstehung von Metastasen erhoben werden. Allerdings sind für solche Untersuchungen grosse Patientenzahlen erforderlich. Das Projekt strebt an, die Tumorbanken der 5 Universitäten in der Schweiz zu vernetzen. In einer ersten Phase wird versucht, die Pathologieberichte so zu strukturieren, dass eine Vernetzung mittels moderner Informationstechnologien möglich wird. Dabei fokussiert man auf Leber-, Nieren-, Lymphknotenkrebs und neuroendokrine Tumoren. Wenn die Pathologieberichte strukturiert vorliegen, werden sie mit den Informationen der Tumorgewebebanken erweitert. Danach sollen in einer zweiten Phase die genannten Tumorgruppen molekularbiologisch analysiert werden, um die Entstehung von Metastasen besser zu verstehen.

Wissenschaftliche und gesellschaftliche Kontext des Forschungsprojekts

Das Projekt schafft die Grundlagen für den zukünftigen Austausch von Daten innerhalb der Schweiz. Durch die Vernetzung der Biobanken wird es möglich werden, dass Forscher auf grosse Datensätze zurückgreifen können und Daten austauschbar werden. 

 

Direct link to Lay Summary Last update: 25.09.2017

Responsible applicant and co-applicants

Employees

Publications

Publication
Advancing synoptic cancer reports beyond English: the University of Bern/PathoLink approach
Banz Yara, Berezowska Sabina, de Leval Laurence, Rubbia-Brandt Laura, Tolnay Markus, Moch Holger, Perren Aurel, Hewer Ekkehard (2018), Advancing synoptic cancer reports beyond English: the University of Bern/PathoLink approach, in Virchows Archiv, 473(5), 655-656.

Associated projects

Number Title Start Funding scheme
188639 Metabolic changes in early and late progression steps of pancreatic neuroendocrine tumors 01.08.2020 Project funding (Div. I-III)
172954 Discovery and deciphering of genetic lesions and molecular mechanisms underlying the emergence and biology of nodal peripheral/mature T-cell lymphoma 01.04.2018 Project funding (Div. I-III)

Abstract

Development of metastases and chemoresistance in recurrent tumors are the most common cause of cancer-related death. Most studies on these topics are based on in-vitro cell line models or primary tumors before therapy. Cutting-edge high-throughput technologies are able to identify tumor subclones with specific mutations or are able to analyze the whole tumor proteome. However, such technologies require frozen tissue. Currently, tumor biobanks contain only very few samples of metastatic tumor tissues or tissue samples from chemo-resistant tumors obtained after therapy. In the PathoLink project, we propose to determine the mechanisms of metastasis formation and the consequences of systemic treatment by connecting the biobanks of all five university pathologies. Patients and the research community of Switzerland will benefit from PathoLink not only through novel insights that lead to improved treatment in the future, but also through the introduction of standardized patient reports in biobanks. These goals will initially be pursued on five topics, namely liver tumors, endocrine tumors, renal cell carcinoma, lymphomas and metastases. The PathoLink project will also establish new tools for high quality and precision biobanking and IT solutions for large-scale clinical and genomic data integration. The project will generate a unique dataset of exceptional scientific and medical value and will lead to novel treatment strategies against metastasizing cancers. We will make these data available to the Swiss biomedical research community in a technically sound and ethically transparent manner. Finally, PathoLink will significantly contribute to a nationwide interoperability of clinical and omics data in Switzerland.
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