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Genetics of miRNA action and biogenesis-II

English title Genetics of miRNA action and biogenesis-II
Applicant Voinnet Olivier
Number 152832
Funding scheme Project funding (Div. I-III)
Research institution Departement Umweltsystemwissenschaften ETH Zürich
Institution of higher education ETH Zurich - ETHZ
Main discipline Botany
Start/End 01.08.2014 - 30.09.2015
Approved amount 327'992.00
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Keywords (9)

high resolution; siRNA; miRNA; Translation inhibition; non-cell autonomy; cell-specificity; Forward genetics; slicing; SHORE mapping

Lay Summary (French)

Lead
Une myriade de petits RNAs régulateurs existe chez les plantes, dont les microRNAs, qui jouent un rôle essentiel dans le développement et les réponses aux stress. En dépit de leur importance, une étude exhaustive des miRNAs dans leur contexte cellulaire spécifique n'a jamais été entreprise chez les plantes, ce que nous proposons de réaliser dans le projet.
Lay summary

Depuis leur découverte récente, les microRNAs sont l'objet d'études intensives concernant leur biogenèse et leurs modes d'action.  Tant chez les animaux que chez les végétaux, il apparait que les effets de ces molécules sont extrêmement cellule-spécifiques, alors que  paradoxalement, leur étude est en général conduite à l'échelle du tissu, de l'organe ou de l'organisme entier. L'absence de résolution fine à l'échelle cellulaire conduit donc à interpréter les régulations orchestrées par les miRNAs sous forme d'une 'moyenne' peu représentative de la diversité et de la spécificité de leur action au sein des types cellulaires constituant un organe considéré. En exploitant le système racinaire de la plante modèle Arabidopsis thaliana, le projet vise à établir une carte exhaustive de la biogenèse, du mouvement , et de l'activité de l'ensemble des miRNAs présents dans chaque type cellulaire composant la racine, un effort sans précédant qui devrait apporter de nombreux éclaircissements quant à la dynamique spatio-temporelle de la régulation de l'expression du génome de la plante.

Direct link to Lay Summary Last update: 25.02.2015

Responsible applicant and co-applicants

Employees

Associated projects

Number Title Start Funding scheme
132907 Genetics of miRNA action and biogenesis 01.08.2011 Project funding (Div. I-III)
141735 NCCR RNA & disease: Understanding the role of RNA biology in disease mechanisms (phase I) 01.05.2014 National Centres of Competence in Research (NCCRs)

Abstract

This project is proposed as part of an incentive of the SNF to provide an extension to "Genetics of miRNA action and biogenesis" through a Bonus of Excellence. It capitalizes on outstanding results obtained over the past two years, which require deeper exploration in the longer run. These aspects include the molecular characterization of key mutations in the AGO1-dependent miRNA pathway in Arabidopsis, of which some also affect the functioning of a viral suppressor of RNA silencing. The project will also expand significantly our original investigation of the AGO1 protein complex, by exploring its cell-specific partners and mode(s) of action in the root system, and deciphering strucural aspects that allow AGO1 to trigger silencing amplification in the presence of specifically sized sRNA cargoes. Finally, we will exploit a unique series of molecular tools, which we have built to explore sRNA biogenesis, action and mobility with an unprecedented level of resolution.
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